“谢谢。”
陈辉真心实意的感谢,这些天唐剑带的饭菜都还是很丰盛的,有几次他甚至还特意跑到校外去买特色菜,这五天时间陈辉还没吃过重样的菜,这位唐师兄显然是费了心思的。
陈辉还是很满意的,这几天吃得的确不错,当然,他也不挑食就是了。
“客气。”
“我们实验室可就指着你出成果呢,那可不能怠慢了。”
唐剑笑盈盈的说道。
这些天他跟陈辉接触不少,不知道为什么,他竟然觉得眼前这个年轻人给他一种很可靠的感觉,这种感觉来得莫名其妙,却毫不客气的压倒了他的其他想法。
陈辉笑了笑,没有说话。
他的研究的确遇到了困难,有点没有底气说话。
“你已经完成建模了?”
忽然,唐剑看到了陈辉电脑屏幕上的仿真结果,笑容僵硬在脸上,瞪大的眼睛就像金鱼一般,都快要凸出来了。
他没想到这个本科生竟然真的完成了数据处理,这完美的结果,他们几个博士生搞了几个月都没有做出来。
“还差得远。”
陈辉吃了一块牛肉,摇了摇头,“过拟合了,没办法用这个模型进行预测。”
这牛肉倒是真如唐剑所说,鲜嫩多汁,但陈辉觉得,这道菜的精髓还在这酱汁上,饶是吃惯了山珍海味的他,也觉得这道菜吃起来很不错。
“啊?”
“过拟合了?”
唐剑瞪大眼睛,凑到屏幕前,仔细研究了好长时间,才终于发现陈辉说的问题。
但这个问题在他眼中根本就不算问题,跟理论数学不一样,理论数学要求结果绝对的正确,最好是公理、定理这种绝对正确的东西。
实际实验却并不需要,只需要能够满足一定的精度就已经足够了。
如果他能够做出这样的结果,早就跑去发论文了。
“这个结果已经足够完美,我现在就去通知老师。”
唐剑说着往实验室外走去,满脸兴奋之色。
“不着急,这个模型还能改进,等最后结果出来再说吧。”
陈辉摆摆手,拿这样的结果去糊弄人,他还真丢不起这个人。
唐剑站在会议室门口,看看展现着模型结果的电脑屏幕,又看看陈辉,一时间不知道该说些什么。
一方面他听到陈辉说结果还能再改进,他心中充满了期待。
可他认为这个结果已经足够完美了,他很难相信这个结果还能再改进。
在他看来,这个模型已经完全可以用于实际应用,根本就不需要再做改进,根本没必要浪费时间。
不过最终在一阵纠结之后,他还是决定听陈辉的,都已经等了好几个月了,再多等几天也无妨。
……
唐剑刚走出会议室,就有一个师妹走了过来,低声对他说道,“大师兄,那家伙都快一周没有出实验室了,他是真在研究还是在这儿蹭吃蹭喝啊?”
不止是这位师妹,实验室中其他师弟师妹们也都向这边看来,他们也很好奇。
不仅是好奇,他们对陈辉的看法也很复杂,如果是他们,让他们在会议室里住几天,他们必定无法忍受,即便因为他们做实验偶尔也会熬夜,所以会议室中有个行军床。
可但凡有得选,他们也会选择回寝室享受自己的大床,而不是在这儿受罪。
这样的精神让他们震撼。
但他们实在无法想象一位本科生能解决这么复杂的问题,所以陈辉的行为在他们眼里就有点作秀的嫌疑了。
“住嘴。”
“你怎么能这么编排陈师弟?”
“太不礼貌了。”
唐剑神色一历,怒声呵斥了这位师妹一句。
实验室中其他人都是瞳孔地震,呆愣在位置上,一时间竟然有些茫然。
他们以前哪里见过大师兄这幅忿怒金刚的面孔。
大师兄在实验室一贯是好好先生,不要说这般严厉的呵斥,就是一句重话都没有对师弟师妹们说过,平时哪怕是有师弟师妹们闯祸了,他都不会太过严厉的斥责师弟师妹,反而是会去老师那顶罪,让师弟师妹们免受惩罚。
“好教你们知道,”
唐剑看向实验室中神色各异的师弟师妹们,“陈师弟已经做出成果了!”
“模型的拟合度几乎完美,这样的成果足以发表一篇顶刊,如果加上我们完整的课题,上《细胞》、《自然》或者《科学》都没问题。”
呼呼……
一阵微风吹过实验室。
实验室中众人就像是石化了一般,那个本科生竟然真的完成了建模?
他们觉得大师兄今天可能是中邪了。
“那还等什么,赶紧写论文啊,他的模型在哪?”
一位师弟忽然说道,“我现在就去通知老师!”
“不用了。”
唐剑摆了摆手,“陈师弟还在改进模型,等精度更高的模型出来后再说吧。”
听到这话,实验室中的师弟师妹们顿时你看看我,我看看你,眼中满是狐疑之色,感觉大师兄的话的可信度顿时大打折扣。
如果真是能够上《细胞》、《自然》、《科学》的成果,那还能怎么改进呢?
开创一个新时代?在肿瘤研究领域称宗做主,成为数学界高斯、欧拉般的存在?
即便他们是华夏顶尖实验室的顶尖博士生,也还没狂妄到这种地步,他们甚至做梦都没这么想过,他们想都不敢想的事情,难道一个本科生还真能做到?
无稽之谈!
唐剑摇摇头,没有再多说什么,他现在说什么都是苍白的,只有模型摆在这些家伙面前,才会让他们改变想法。
不管陈师弟最后能不能成功改进模型,即便是陈师弟现在的模型,就足以让这些家伙为自己现在的想法感到惭愧。
他相信这一天并不会等太久。
第313章 陈师弟牛逼
吃过饭,陈辉收拾好垃圾,放在一旁垃圾桶中,再次回到电脑前。
刚刚吃饭时,放空大脑的他已经找到了新的灵感,他意识到,这是生物,这是医学,不能仅靠纯数学驱动,必须给模型加入生物学约束!
登陆上专业的论文网站,陈辉开始搜索蛋白质相互作用的数据库和已知的信号通路图谱相关的论文,他之前就了解过这方面的内容,但并没有深入研究。
时间一天天过去,陈辉如同一块饥渴的海绵,疯狂的吸收着一切知识。
一周后,万事俱备,陈辉开始继续改进自己的模型,他没有直接套用,而是将这些知识转化为弱先验信息,即哪些蛋白之间更可能存在相互作用,基于已知复合体、结构域相似性等,为模型提供一些模糊的、概率性的指导。
然后陈辉采用贝叶斯网络的机器学习方法,这种方法特别适合从数据中推断因果关系网络,并且可以方便地融入他收集到的弱先验信息作为约束。
很快,新的模型完成。
新模型运行后,得到了一个初步的、概率性的网络图。
图中指向了一个之前被忽略的、名为PKCδ的蛋白激酶可能处于这个新通路的核心位置。
陈辉露出开心的笑容,忙碌了这么多天,终于有了个还不错的结果。
然而很快,陈辉就皱起了眉头,在模型中,PKCδ与上游的联接仍然模糊,光是目前的信息,根本没办法提供足够的置信度。
进步了,但还不够!
陈辉深吸一口气,他早已经习惯了这样的攻坚研究,非但没有感觉气馁,甚至斗志昂扬。
这一次,他足足花了三天时间,也依旧没有想到更好的思路。
研究似乎已经陷入了僵局。
期间宋朝明也来过几次,毕竟陈辉来他们团队也已经接近半个月了,却一点动静都没有,他自然得来看看。
原本还有些忐忑的他,在见到陈辉第二版的模型后,差点兴奋得在会议室中跳起舞来。
不过他还是赞成陈辉严谨的态度。
跟唐剑不同,他现在早已经功成名就,即便多一篇《自然》《科学》也并不能给他带来太大的好处,所以他对发论文的执念没有那么深。
他们研究的是肿瘤,最终的研究成果是要用到病人身上的,可不能真的就用一个看似完美的成果去替代真实情况。
即便药物会提前经过动物测试,但谁也说不准最后会不会出现什么可怕的后果,自然需要慎之又慎。
更何况,这才半个月,陈辉就能做出这样令人惊喜的结果,他根本不介意再多等几个月。
呼!
长出一口气,陈辉目光从屏幕上移开,暂时放空一下大脑。
他的确遇到了难题。
几秒钟后,陈辉目光再次恢复坚定,再次看向电脑屏幕,然后移动鼠标,再次打开了宋朝明团队的历史研究数据。
既然前方一片黑暗,暂时找不到路,那不如回头看看,从这些数据中去寻找可能的线索。
又是一周时间,这一次,陈辉以更加细致的方式去审视这些数据,比之前耗费了更多的时间,但想要的灵感依旧没有到来。
做科研就是这样,即便你花费了大量的时间精力,费尽了心血,也不一定能出成果,说不定偶尔一个突然的想法,反而能有大发现。
凌晨两点,陈辉在会议室中缓缓移动鼠标,锐利的目光在纷繁的数据中不断流转。
时间一点一点流逝。
很快已经是两点五十。
陈辉收回目光,他准备睡觉了。
从初中开始,他的睡眠都十分规律,如果没有什么紧急的事情,他都是凌晨三点睡觉,早上六点起床。
正是规律的睡眠,让他拥有一副好身体,让他能够保持旺盛的精力进行学习研究。
忽然,陈辉双眼微眯。
他在实验记录中注意到了一个被所有人忽略的细节,那批质谱数据是不同时间点0h,1h,6h,24h的采样!
而之前的分析,都下意识地把它们合并处理了,试图找一个静态网络。
但显然,信号通路的激活是一个动态过程!
就像看一场传球比赛,你必须看视频回放,而不是看一张合影,才能知道是谁传给了谁。
灵光乍现,随后便是无数灵光涌现。
就像是敲开了那层遮蔽泉水的纸片,随后便是地涌金泉!
陈辉立刻转向了动态贝叶斯网络和时间序列分析,他将不同时间点的数据按照其内在时间关系串联起来。